農業代謝服務
最新資訊
農業代謝服務 - 廣泛靶向代謝組

   產品簡介

廣泛靶向代謝組技術平臺建立了LC-MS/MS代謝物數據庫,區別于現有代謝物檢測方法,整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點,創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測,為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。同時,結合氣-質聯用(GC-MS)和核磁共振(NMR )無創檢測手段,進一步豐富了初生代謝產物和次生代謝物的檢測和鑒定的多樣性。

  • 應用領域
  • 批量檢測和鑒定次生代謝物質
  • 檢測和鑒定中低豐度物質
  • 結合轉錄組和基因組學數據開展生物學研究
  • 建立物種代謝物數據庫

技術特點

  廣泛靶向代謝組 靶向代謝組 非靶向代謝組

目的

組學水平檢測代謝物
尋找Biomarker
關注目標通路代謝物
研究調控機制

單個或少量目標代謝物檢測

組學水平檢測代謝物

優點

批量準確鑒定代謝物
高靈敏度,發現低豐度代謝物
自建代謝物數據庫,既檢測已知代謝物也發現新代謝物,同時實現相對定量

定性、絕對定量;

非靶向檢測代謝物,通量高,操作簡單

缺點 進樣處理復雜,檢測過程較繁瑣;
需要自建代謝物數據庫

 

通量低,需使用標準品;

難準確鑒定代謝物;
靈敏度低、難檢測低;
依賴公共數據庫,只能檢測數據庫已知代謝物,難以發現新代謝物

 

技術路線

1.樣品類型

a.細胞,取樣后離心,去除培養基,立即放人液氮中,之后-80°保存;
b.葉片、莖、花等,取下后立即放人液氮中,之后-80°保存;
c.果實的果肉、果皮等,如果野外現場不具備分離條件,需盡快(30 min內)轉移至室內,分離樣品放入液氮中,之后-80°保存。

2.混合取樣:

每份樣品混合來自至少3株以上的組織。以水稻葉片為例:取同一時期,表型基本一致的同一個部位的1片葉片,同時取6株,放到10ml離心管中,并迅速放入液氮中。

3.樣品重量和重復:

每份樣品取樣鮮重3-5g(干重不低于1g)。
準備3個以上重復,剩余備份。

4.儲存和運輸:

足量干冰運輸,不能反復凍融

[案例一] 廣泛靶向代謝組技術的建立以及在水稻代謝組學研究中的應用[1]

本研究中,一種創新的基于步移MIM-EPI方法的廣泛靶向代謝組檢測技術成功建立。該方法首次在水稻材料中應用,初步獲得698種代謝產物,其中135種代謝物得到鑒定和注釋,包括許多重要的次生代謝物質。

 
圖1 廣泛靶向代謝組檢測結果,靈敏度高,能檢測到豐富的中低豐度代謝物
 
 
圖2 一級、二級質譜結果,準確定性代謝物
 
 
圖3.比較ZS97 和IRAT10旱脅迫后代謝物變化情況

參考文獻

  • Wei Chen, Liang Gong, Zilong Guo. et al. A novel integrated method for large-scale detection, identification, and quantification of widely targeted metabolites: application in the study of rice metabolomics. Molecular Plant, 2013, 6,1769-1780.
记忆盛宴官网